三千年前，维达一族摧毁了电磁星，余下的电磁星人乘搭一座电磁岛前往地球。但岛上混进了维达怪物，电磁星人与它们展开战斗。其后电磁星人和维达怪物全部战死，岛上只剩下一只机械犬IC。 三千年后，维达一族入侵地球，此时电磁岛唤醒了IC。IC召集了五位战士组成电子战队电磁人，让电磁人与维达一族战斗。
经历了一番波折，曾经的暗黑系中二深度患者富樫勇太（福山润 配音）终于和现役中二中毒者小鸟游六花（内田真礼 配音）确立了恋爱关系。因妈妈出差和爷爷的失误，六花暂时借住在勇太家中，二人开始实质的同居生活。转眼他们升入了高二，青春气息鄙人的校园内，一色诚（保志总一朗 配音）换了新的发型，丹生谷森夏（赤崎千夏 配音）发誓君临校园，凸守早苗（上坂堇 配音）和阿森的爱憎对决依然继续，变成三年级的“残念生”五月七日茴香（浅仓幸美 配音）则冷感继续。
