1942年12月，犹太儿童莎拉（Sarah）和丹尼尔（Daniel）将被遣送出国，他们一直藏在小朋友奥托（Otto）和格尔达（Gerda）家人的地下室，但还是被德国人发现了。两家父母都被德国人逮捕，只有四个孩子从森林中得以逃脱。他们的目标是前往瑞典，在路上他们认识了一个好心人，但是他们真的可以一直信任他吗？
在城市的破败角落，脑顶光秃秃的重案组老警察入职三十年，虽然破了许多大案要案，满身都是伤痕弹孔，但是他的家庭情况却一团糟。老婆和他离婚，儿子嫌他臭。与老警察相对，青年私家侦探波比（黄磊 配音）如日中天，扶摇直上，FBI请他讲课，相关动画片热播，波比俨然成为福尔摩斯一般的存在。在某起密室杀人案后，老警察不得已请来波比调查。波比为什么会这么厉害，这一切似乎都与他的妈妈麦太（吴君如 配音）有关。在崇拜他的小孩子们的追问下，波比的思绪回到孩童时代，麦兜（张正中 配音）和妈妈共处的那个快乐无忧的童年，一切美好都早已注定……
年轻男子谋杀案的调查出现转折，因为警方发现有个人与嫌疑人长得很像！
炎炎夏日，东京八王子郊外社区，一对夫妇惨遭杀害。事后凶手用血在墙上写下大大的“怒”字，随后逃亡，销声匿迹长达一年之久。而在此期间，三个身份不明的男子和身边的人相遇了。曾自甘堕落的爱子（宫崎葵 饰）被父亲（渡边谦 饰）领回海滨小镇，邂逅了不善言辞的哲也（松山研一 饰）。在东京工作的同性恋优马（妻夫木聪 饰）将柔情似水的直人（绫野刚 饰）带回了家，他不相信对方，却又尝试去相信。随母亲搬到冲绳的小泉（广濑铃 饰）跟着同学辰哉（佐久本宝 饰）登上一座荒岛，在废墟中遇到了背包客田中（森山未来 饰），他们短暂成为朋友，而可怕的命运突然降临泉的头上。不久之后，通缉令遍布全国，三个男子的真实身份引人生疑……
