痛觉残留：经历了和职业炸弹狂魔仓密目琉夏的惨烈对决后，伤痕累累的两仪式（坂本真绫 配音）待在家中静养。适逢黑桐干也（铃村健一 配音）需外出公干，他自顾自将一只黑猫托付给两仪照看。两仪与黑猫的关系巧巧起了变化；俯瞰风景：礼园女子学院八名女孩自杀，宫月理理栖（种田梨沙 配音）凭吊自杀的好友安藤由子，后悔自己没有和她一同赴死。就在此时，业已失明的浅上藤乃（能登麻美子 配音）出现在宫月面前；新年参拜：1998年即将过去，干也和两仪并肩走在去神社参拜的路上。寒冷的冬夜，两颗孤独之心不知不觉越来越近。 本片根据武内崇创作绘制的三个短篇漫画改编。
“黑桐，你知道吗，杀人和杀戮是不一样的。据说，人一生只能杀一个人？” 从心底里渴望成为“特别”的存在。 这种愿望作出了错误的选择。不，应该说是被错误引导出了这种愿望。那时候，深信这是唯一的也是最好的方法。 这是4年前也就是1995年和她相遇时发生的事。 次年即1996年，她陷入了沉眠。然而，罪恶的萌芽却在不知不觉中发育成长。 然后，两年后的1998年，她苏醒了，开始镌写新的时刻。与此同时，想得到她的意图也蠢蠢欲动……在，4年后的1999年。 所有得到她的手段都本该有破绽的。可是，命运的齿轮偏离了轨道。 4年之后再度反复的恶魔杀人事件。暗夜杀人犯是潜藏在她内心深处的杀人冲动和已经无迹可寻的“织”，已经想不起来。 到底杀的是“谁”， 为此，她徘徊在深夜的街头， 为此，他为了她在黑夜里往复。 杀人和杀戮的不同，是特别和普通的差异，是戾气和正气的差别。明明重要的不是这些而是自己的存在，却被这些对错所囚禁—— 明明希望的只是重要的人可以好好活着，这理所当然的事却背负上了曾经的罪孽——
1999年1月，黑桐鲜花所就读的高级女子中学——礼园出现了神秘的事件。一年四班的学生橘佳织在宿舍起火事件中身亡，随后，一年四班全体同学的生活改变了。每天活在痛苦与烦恼中的她们，收到了不明来源的信件。不安的情绪在礼园全体学生间蔓延。为了解决事件，两仪式假扮学生潜入礼园，与黑桐鲜花一同调查事件的原委。另一方面，黑桐干也在使用自己的方法追踪事件的真相。而事件的背后，似乎还有那个男人，魔术师荒耶宗莲的安排。 苍崎橙子之徒黑桐鲜花，拥有“直死之魔眼”的两仪式，魔术与战斗的交叉，礼园的秘密在她们面前展开。 日本同人小说最高境界《空之境界》全七章动画化，本作为第六章电影版。
“荒耶，你在追求什么？”“真正的睿智。”“在哪里追求？”“只在自己的心里。” 1998年11月，胭条巴遇到了两仪式并被她吸引。胭条巴每晚都做噩梦，自己犯下的罪行不断重现。两仪式为了调查事件的真相，前往胭条巴的寓所，却不知道，他们不知不觉已经进了敌人的圈套——复杂的“矛盾螺旋”。 而在这一切的背后，是名为荒耶宗莲的男子。他宿命的劲敌是魔术师苍崎橙子，最强的人偶师。伽藍堂全体出动，赌上性命的战斗即将开始。 日本同人小说最高境界《空之境界》全七章动画化，本作为第五章电影版。
我想知道。我想知道爱情是什么样的。高中二年级的小鸠与长内结束了互惠互利的关系。长井开始与报社一年级会员乌拉诺斯约会。为了留下自己上过学的证据，也为了给长内留下好印象，上野努力让学校报刊登发生在该市的一起纵火事件。与此同时，小羽开始和他的同学中丸约会。原本过着平静生活的他，却突然发现河岸边发生了纵火事件……作为普通人重新开始的小鸠君和长内同学，又会发生怎样的故事呢？
1998年06月，意外事故后昏睡两年的两仪式苏醒了。 18年的记忆没有了，两仪织的人格也代替两仪式死去了。只有名为“黑桐干也”的男子守护在自己的身边。还有眼前奇怪的现象。两仪式获得了直视万物死之线的异形之力“直死之眼”。 黑桐干也的上司，苍崎橙子，来到医院接触两仪式，教导她“直死之眼”的使用方法。医院突然遭到袭击，式手握匕首，跨出了2年来，最坚毅的一步。 日本同人小说最高境界《空之境界》全七章动画化，本作为第四章电影版。
1998年7月，饮酒会归来的下雨之夜，黑桐干也收留了一位无家可归的少女。但不久，少女不辞而别，去向不明。 与此同时，发生了连续杀人事件。死者无一例外，都是由于身体被强大的力量过渡扭曲而死。伽蓝堂开始为此展开调查。 一步步深入的调查，犯罪者居然是当时不辞而别的少女浅上藤乃，而她的能力更是惊人的强大。两仪式，拥有“直死之眼”的少女，再次提起匕首迎战。 日本同人小说最高境界《空之境界》全七章动画化，本作为第三章电影版。
1995年9月，16岁的两仪式与黑桐干也相遇了。 男孩子气的两仪式穿着和服来到学校，特殊的她与任何人都没有交集，除了黑桐干也。二人产生了某种关联，并开始了安稳的校园生活。 同时，街上出现了连续猎奇杀人事件。由于警察朋友的关系，黑桐了解了一些内幕，他感到这个事件与式的双重人格有某种关系。 两仪式与两仪织，猎奇杀人事件的真相到底是什么？两仪家的秘密在黑桐眼前逐渐展开。 日本同人小说最高境界《空之境界》全七章动画化，本作为第二章电影版。
1998年9月，围绕巫条大厦发生了连续少女坠楼事件。媒体将其报道为无法解释的自杀事件，而有一个人，看出了事件背后的某种关联。 她是魔术师苍崎橙子，伽蓝堂事务所的所长。解决都市不可思议事件的伽蓝堂只有三位成员：苍崎橙子、黑桐干也、两仪式。拥有“直死之眼”的两仪式受橙子所托，前往巫条大厦调查。等待她的是意想不到的敌人，而对抗敌人的武器，只有那把一直在式手中的匕首。而远在伽蓝堂，黑桐似乎被巫条大厦的魔力控制，失去了知觉。 日本同人小说最高境界《空之境界》全七章动画化，本作为第一章电影版。
